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O Museu de Zoologia da PUC-PR iniciou suas atividades em 1945, na antiga Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Curitiba, com o nome Museu de Biologia. No ano de 1978 mudou o nome para Museu de Zoologia.
Hoje o Museu funciona no Centro de Ciências Biológicas e da Saúde no Campus Curitiba da PUC-PR. Esse espaço tem um papel importante como suporte prático para as aulas dos cursos de Biologia, Farmácia e Bioquímica, Medicina Veterinária, Agronomia, Zootecnia, Medicina, Odontologia e Enfermagem. Existem atualmente aproximadamente 10.000 espécimes de vertebrados e invertebrados catalogados ou tombados.
O Museu de Zoologia mantém intercâmbio com o Museu de História Natural de Curitiba, com o Zoológico Municipal, com o Passeio Público e, mais estreitamente, com o Centro de Triagem de Animais Silvestres Vivat Floresta (IBAMA/PUCPR), em Tijucas do Sul.