Entre os objetos destacam-se também peças indígenas - especula-se que índios Umbus e, posteriormente, Guaranis povoaram a região. Em exibição, pedras lascadas e polidas para uso doméstico, armas para caça, pesca e sacrifícios (a "machadinha de sacrifício", ainda sem datação, utilizada em rituais) e também instrumentos usados nas colheitas e ornamentos para os dias de festa. A maioria das peças está intacta.

O museu fica no antigo pátio da ferrovia da Estrada de Ferro Sorocabana. Sua construção em Ourinhos, no início de 1905, atraiu trabalhadores de outras cidades da região. A ferrovia liga Ourinhos às capitais São Paulo e Curitiba, a outras cidades do Paraná e do interior paulista, como Assis e Avaré. Ela funcionou por muitos anos para transporte de passageiros e atualmente serve somente para o transporte da produção agrícola da região.