Desde sua criação, em 1969, o Museu estava sob domínio do Estado, sendo que os bens móveis e acervo foram doados ao Município, passando a responsabiliadde para a Prefeitura, de acordo com o artigo 3º do decreto nº 44.735, de 03/03/2000. Em 1981, o imóvel foi tombado e restaurado pelo CONDEPHAAT, através da resolução nº 017, de 23 de maio. O Museu é temático, e conta com registros da época da ferrovia e do início da cidade, assim como objetos pertencentes às fazendas de café e do compositor santarritense Zequinha de Abreu.

Criado em 1969, pelo governador do Estado de São Paulo, teve como organizadora a professora Nerita Arruda Kastein, que iniciou trabalho de pesquisas e sondagens para arrecadar material alusivo à Zequinha de Abreu, à vultos relacionados com a música, também peças artísticas e pedagógicas. Através de contato pessoais, cartas e ofícios com membros da família do compositor foram obtidos dados, como: peças, informações sobre a vida e obra do Maestro. Igualmente preciosos são os objetos da época da escravidão e Império, arrolados após a falência da Usina Vassununga.