Para compreender o passado da humanidade, não basta ler a respeito dele. Muita informação sobre os ancestrais do homem está depositada em objetos, pinturas e demais vestígios deixados por eles no ambiente em que viviam. A exposição de Arqueologia do MHNJB permite que o visitante observe e analise, de perto, utensílios e manifestações artísticas produzidas, há muitos anos, pelos seres humanos. O acervo exposto compõe-se de materiais em pedra polida, picoteada e lascada, de painéis, em que se reproduzem pinturas rupestres encontradas em diferentes regiões de Minas Gerais, e, também, de vários artefatos e peças de cerâmica.