O Museu do Cárcere, como um dos mais importantes equipamentos culturais da Ilha Grande, tem o importante papel, de apresentar ao público visões acerca das políticas carcerárias implementadas ao longo do período Republicano, em especial no Rio de Janeiro, e seus reflexos na sociedade cotidiana.

Desse modo, desenvolve atividades de educação  inclusiva, incorporando a ecologia dos saberes de amplos setores da população, através de cursos gratuitos de formação de ecomonitores, oficinas de sensibilização, arte-educação, atendimento às escolas e grupos de visitantes. Desenvolve ainda atividades de preservação, investigação e divulgação dos conhecimentos, patrimônio, suporte de memória social, relacionados à História do Sistema Prisional e da Região.